Возникает при употреблении воды с открытых водоемов, т. е. характеризуется фекальнооральным путем передачи инфекции. Инкубационный период длится от 20 до 65 дней.

В симптоматике превалируют клинические проявления гепатита А. В начальном периоде лихорадочная реакция не выражена. Беспокоят слабость, отсутствие аппетита, тошнота, ноющие боли в правом подреберье. С появлением желтухи интенсивность общей интоксикации не уменьшается, что отличает гепатит Е от гепатита А.

Желтушный период продолжается 2-3 недели. Специфическим маркером гепатита Е служит обнаружение в крови анти-HEV. Хронизации не вызывает.